Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNRF3Q9ULT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms