Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INO80Q9ULG1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms