Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF608Q9ULD9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms