Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms