Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms