Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms