Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms