Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH10Q9P2E7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms