Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms