Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms