Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms