Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms