Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms