Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms