Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms