Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8A2Q9NTI2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms