Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKDREJQ9NTG1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKDREJQ9NTG1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms