Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms