Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms