Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms