Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 WBP2-212ENST00000589834 591 ntTSL 219.06■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 WBP2-206ENST00000587374 480 ntTSL 418.81■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 GTPBP2-204ENST00000432918 1850 ntTSL 318.57■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 18.1
DROSHAQ9NRR4 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-7■■■□□ 18.1
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DROSHAQ9NRR4 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 18.1
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DROSHAQ9NRR4 LINC00969-235ENST00000598992 1005 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 18.1
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DROSHAQ9NRR4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.144e-17■■■□□ 18.1
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DROSHAQ9NRR4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.827e-8■■■□□ 18
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DROSHAQ9NRR4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.266e-8■■■□□ 18
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DROSHAQ9NRR4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.691e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.473e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 516.33■□□□□ 0.21e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 TSC22D4-206ENST00000496728 837 ntTSL 330.86■■■□□ 2.532e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.514e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 520.23■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.949e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.669e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 229.02■■■□□ 2.249e-7■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.829e-7■■■□□ 18
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