Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX2Q9NRD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX2Q9NRD8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms