Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM7Q9NR12 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM7Q9NR12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms