Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms