Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms