Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4BQ9NPR2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms