Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms