Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG4Q9H9E3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG4Q9H9E3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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