Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6BQ9H3T3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6BQ9H3T3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms