Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCL11BQ9C0K0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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