Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LNPKQ9C0E8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LNPKQ9C0E8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms