Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms