Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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FOXQ1Q9C009 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXQ1Q9C009 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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