Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms