Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCD2Q9BXW9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCD2Q9BXW9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms