Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms