Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms