Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms