Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF8Q9BRL6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF8Q9BRL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms