Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TXNDC17Q9BRA2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms