Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms