Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX2Q99697 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms