Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF2Q99496 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF2Q99496 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms