Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CICQ96RK0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms