Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms