Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms