Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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