Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC114Q96M63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC114Q96M63 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms