Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIMPOLQ96LW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIMPOLQ96LW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms