Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SAMD8Q96LT4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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